TIPS在有肝衰竭和复发出血的病人中的应用，应该与移植中心和移植医生协调进行。Child评分超过11分和/或有其它危险因子的病人（升高的ALT水平，TIPS前脑病，升高的胆红素水平），而且不适合移植的病人的死亡率，在TIPS后的几个星期内超过90％，因此，分流可能并不合适。
适合肝移植的病人根据标准化的要求，通常被放在一个等待的名单上。具有爆发性肝衰竭的病人通常是最优先的。他们之后是慢性肝衰竭的病人（Child－Pugh评分超过10分），他们由于难治性的静脉曲张出血、手术或者经颈静脉分流失败而住在加强监护单元内。在具有慢性肝衰竭和静脉曲张出血的病人中，不需要加强监护治疗的病人是最不急需肝脏移植的。移植的禁忌证包括对抗菌剂治疗无反应的肝外脓肿、需要大剂量或者多种升压药来维持足够血压的、严重、不可逆多器官衰竭，等等。
理论上，TIPS对需要肝移植前分流，以控制出血的待移植病人具有很多优于外科手术之处。所有外科分流都会增加肝切除术的难度，对以后移植的肝脏造成影响。分流术将血流从原来的肝转出可能会使门静脉更小、更加纤维化。相反的，TIPS保持了通过门静脉的高血流量，防止门脉发生血栓并保持了移植肝的高血供。TIPS支撑架将随病肝一起切除，因此不需要在以后行手术来关闭纤维化和经常变脆的分流通路。有发表的研究显示TIPS比外科分流术效果更好。但是，这些数据并不被所有移植医师所接受，某些医师反对在肝移植前进行TIPS植入。
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