并非所有复发或者重复出血的病例都适于行TIPS。禁忌证可能是技术上的或者临床上的。
过去最常见的技术上的禁忌证是门静脉闭塞。但是，现在TIPS有时可以在局部门静脉闭塞的患者中成功的应用，TIPS甚至可以在慢性闭塞病人中的完成。在回顾性研究中报道了其良好的临床效果，技术上成功率达到了75％。使用经皮血管内结合的方法在具有门静脉海绵状变性的病人中都可以成功进行TIPS。另外TIPS的相对禁忌证是多囊肝。另外罕见的情况是体重超过了可以使用血管造影设备的技术限制的极限，这在国外常见。
临床禁忌证是指在某些情况下降低门静脉高压将会导致肝功能衰竭或者PSG（门腔压力梯度）的降低不会改善病人的一般状况。脓肿和心衰是择期TIPS的禁忌证。很明显TIPS可以治疗门静脉高压的并发症但是不能根治引起它的肝脏疾病。大多数研究人员拒绝对Child－Pugh评分12分或者更差的病人行TIPS术，黄疸、昏迷同时肾功能不全和需要人工通气的病人绝对不适合行TIPS。有人研究了个体的预测性差异，发现紧急TIPS，ALT水平>100IU/l（1.7ukat/l），胆红素>3mg/dl（51umol/l），TIPS前脑病都预示着TIPS后的高死亡率。另外一个重要因素是肾功能不全。
已知对肝硬化病人，一次严重的或长时间食道静脉出血对肝功能和病人的一般状态是有害的打击。明显的改善通常见于出血停止之后，因此根据Child－Pugh评分，排除病人进行抢救性（急诊）TIPS的根据：应该是他出血发作之前的评分。另外，酒精性肝硬化导致的静脉曲张，病人出血的发生率高，尤其是他们继续酗酒的情况下，酒精导致的肝细胞衰竭总数将增多。
除了它们会带来技术上的困难之外，门静脉闭塞从临床观点来看也是复杂的，因为肝细胞肝癌在这种情况下高达35％。肝细胞癌栓在这些病例中的组织学发现超过22％，甚至没有肝细胞癌的临床或者影像学证据。这些病人中的生存时间都在6个月之内，TIPS可能增加了全身转移的危险。另一方面，门静脉血栓时，所有的门静脉血流向曲张静脉，例如胃底食道静脉，或腹膜后静脉丛，增加在急性出血的病例中进行内镜下硬化治疗的困难和失败率。因此，TIPS在急性、临床有明显静脉曲张或者腹膜后出血，甚至恶性门静脉血栓存在的情况下并非禁忌证。
择期TIPS还没有证明TIPS作为一种选择性治疗手段在防止复发性静脉曲张出血方面优于远端脾－肾分流。TIPS的选择性指征防止复发性出血仅在随机化、对照试验中得到了验证，TIPS相对于内镜硬化治疗或者结扎治疗的优势还没有得到证明。目前而言外科分流作为一个择期手术，当病人的状况很好可以手术时，防止复发性静脉曲张出血是优于TIPS的，原因是外科分流功能常能保持更长时间、手术相关并发症却相似。但是，大多数具有复发性静脉曲张出血的病人肝病程度都较高，不是非常好的适合手术的病人。除此之外，不是所有中心都具备训练有素、能够再现学院中心所进行的随机化试验的外科医师。有能力可以安全操作TIPS的放射科医师却可能多一些。另外，选择性TIPS操作的失败给病人带来的风险一般小于外科分流术失败的风险。最后，放射介入手术的“学习周期”可能要小于血管外科的学习周期。因此，正在增加的训练有素的放射科医师多于外科医师就不令人吃惊了。在分流失效的病例中，通常通过球囊血管成形术恢复TIPS的功能要比修复外科分流容易的多。这些TIPS扩张术可以在门诊完成，手术价格在大多数国家也正在迅速下降。抢救性TIPS
在大量复发性出血中使用TIPS被广泛的接受。放射介入手术，在大多数中心，可以被非常迅速的组织并且尤其是不适合手术病人的良好选择。在一些中心，对那些对血管活性药物合内镜硬化治疗没有反应的病人除了使用TIPS之外没有其它选择。TIPS，结合静脉曲张血管内闭塞使用，在大多数情况下都可以控制出血，是具有可以接受的并发症的强有力的工具。附加的硬化治疗在将近40％的病人中会发生并发症并在治疗相关死亡率中占1－2％。出血时间越长，对肝功能的负面影响就越大，发生低血容量性休克的可能性也就越大。因此，在病人临床状况不利时拖延进行TIPS的时间时不明智的。
总而言之，实际的临床情况是选择TIPS作为治疗方法的最终要的因素，但它一般不是第一选择。法则基于本章图7.1所讨论的事实。在当地和可以参与的有经验外科医师，内镜医师和放射医师常常是决定性的。在同一所机构内拥有所有这些专业技术相似或者同一级别的专家的情况非常少见，因此能够进行拥有满意的病人数量随机化、对照试验的可能性非常小。尽管没有清楚的科学证据支持在过去十年内TIPS使用在增加，这并不意味着肝脏病学家和其他医师对标准分析的缺乏，但确实反映了介入放射学是一个快速发展的学科的事实，目前可能提供比外科和介入内镜可以使用的更广泛的专门技能。
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