肝性脑病的发生率基本依赖于肝功能损伤的程度，并与门脉血流的门腔静脉分流有关。TIPS后或外科分流后肝性脑病的发生率明显高于内镜治疗的门脉高压病人。
由于腹水而进行TIPS的病人报道的脑病发生率明显高于由于静脉曲张出血而手术的病人。由于腹水手术的病人肝功能基础更差，因此在TIPS后对门脉灌注的损伤更敏感。这点没有在Rossle和其助手的前瞻性随机试验中得到肯定。在由于难治性腹水接受治疗的病人中，脑病的机率在TIPS治疗和腹腔穿刺治疗的病人中相似。潜在的，例如低容量血症、肾损害和电解质失衡可能在TIPS后得到纠正，因此可能会补偿手术带来的一部分负面影响。然而，门腔静脉性脑病和超过60岁、女性、非酗酒性肝病和低白蛋白血症之间的阳性关联被报道。
由于丢失了门脉血灌注，外科门腔静脉分流后急性进展性肝衰竭的机率被报道在30天之内有4到9%；而进行小的分流可以降低这一机率。TIPS后的急性肝衰竭被报道发生于大约3%的病人中。没有肝衰竭的门腔静脉脑病不能使用口服乳果糖、限制饮食蛋白或者抗生素治疗，发生率在TIPS中为4到7%。在大多数研究中，在随访早期有更高的脑病发生率，此后降低。
所制造分流道闭塞：在有进行性肝衰竭和III和IV级分流后脑病的病人中，紧急的肝移植被认为是决定性的治疗。有肝性脑病而没有肝衰竭（因此称为门腔静脉性肝性脑病）的病人中，最佳的药物治疗也无法控制，脑病可以通过使分流狭窄而得到控制，或者通过有意的闭塞。外科结扎或血管内海绵栓塞或外科分流都在门腔静脉性肝性脑病的治疗中描述过。创造分流狭窄比闭锁分流更安全。对于后者，急性心输出量的降低（多达40%）的同时有腔静脉和肺静脉阻力的升高，门静脉压力的急性增加将导致腹水形成和静脉曲张出血。
制造分流道狭窄的这种技术包括在分流的肝内部分严格的植入缩小支架。Hauenstein等设计的特殊装置（Memotherm TIPS 缩小支架，Angiomed-Bard），是一个25mm长，可自膨胀的镍钛诺支架，可以将它放入直径为8到12mm的支架中。支架侧面的聚酯和棉线形成了一个沙漏形状并提升了继发形成的血栓。
有三个缩减程度可以选择。通过分流的血流被认为可以减少40%。门脉灌注的增加导致的可逆性肝性脑病大约在65%的病人中都有；由血栓导致的血流的完全降低需要一天的时间“成熟”。 “狭窄”支架可以在导管室中手工制作，方法是将缝线结扎在部分释放的Wall支架的中部。缝线可以使支架变成哑铃状。植入“缩窄”支架，允许之后进行分流扩张，防止出血或腹水的复发。另外一种技术是有意栓塞分流通过放置双腔球囊导管。橡胶球囊在分流的头侧部分膨胀。分流通道的更低的部分成为一个死腔。开放门脉分支的血流向肝流动。血栓形成并黏附于分流壁上大约需要24小时；然后球囊被放气并小心的移出。
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