在 Budd-Chiari 综合征（BCS）中，肝静脉的阻塞导致了腹痛、肝大和腹水，最终可以导致门脉高压和肝硬化。在过去，外科手术的门体分流已经证明对于缓解症状和阻滞肝淤血的进程是有效的。TIPS在这种情况下的应用表现出额外的优势，即被分流的门静脉血直接转向进入下腔静脉的肝上段，而不像手术分流进入了下腔静脉的肝下段。这样是有利的，因为BCS患者明显的肝大经常导致肝下段的下腔静脉压力升高，从而降低了标准的门－腔分流的有效性。
虽然，对BCS患者使用TIPS技术上可能有困难，但是已经报道的成功率还是高的。开始向肝静脉插入导管也许是困难的或者是不可能的。如果肝静脉不能插入导管，就将经颈静脉的穿刺针从阻塞的肝静脉残端或者从下腔静脉的肝内段前进到肝，或进入门静脉。
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